江蘇省南京市棲霞區和燕路371號 東南大學(xué)國家大學(xué)科技園科創(chuàng )樓A301
RIP技術(shù)(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA結合蛋白免疫沉淀),是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術(shù)。運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來(lái),然后經(jīng)過(guò)分離純化就可以對結合在復合物上的RNA進(jìn)行分析;即用抗體或表位標記物捕獲細胞核內或細胞質(zhì)中內源性的RNA結合蛋白,防止非特異性的RNA的結合,免疫沉淀把RNA結合蛋白及其結合的RNA一起分離出來(lái),結合的RNA序列通過(guò)microarray(RIP-Chip),定量RT-PCR或 高通量測序(RIP-Seq)方法來(lái)鑒定(圖1)。RIP可以看成是普遍使用的染色質(zhì)免疫沉淀ChIP技術(shù)的類(lèi)似應用,但研究對象是RNA-蛋白復合物而不是DNA-蛋白復合物。
圖1 RIP技術(shù)(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA結合蛋白免疫沉淀)示意圖